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Publiez vos documents !Le principe de la digital PCR (Polymerase Chain Reaction)
Résumé de l'étude de cas
En tant que scientifique qui se respecte, le principe général de la Polymerase Chain Reaction (PCR) doit être connu : il consiste à l'amplification d'une zone matrice d'ADN. Au fil du temps, cette technique n'a sans cesser d'évoluer puisque ces différents types présentent certaines limites d'après la communauté scientifique : PCR conventionnelle (classique), PCR quantitative (qPCR), rt PCR (PCR à partir d'un échantillon d'ARN). Une autre technique PCR fait donc actuellement son entrée dans les laboratoires : la digital PCR (dPCR), aussi nommée numérique PCR. Elle est reconnue pour une plus grande précision, une sensibilité accrue et une évaluation quantitative absolue supérieure. Cette revue communiquera le principe de la digitale PCR avant de présenter les avantages et limites de cette nouvelle technologie.
Sommaire de l'étude de cas
- Reprenons le fondement de la PCR
- Notons le principe de la digital PCR et ses étapes clés
- Des atouts confirmant son succès
- Ses limites
- Ses applications visant l'amélioration scientifique
Extraits de l'étude de cas
[...] Comme, par exemple, l'étape de dispersion demande de la rigueur pour plusieurs paramètres afin de ne pas affecter les résultats : la taille des compartiments, la capacité de débit (nombre de compartiments), la stabilité thermique de la réaction et la vitesse de dispersion. La dPCR, pour son utilisation, demande un matériel très coûteux et très complexe. De plus, les thermocycleurs (permettant les cycles répétés) demandent une consommation élevée en énergie très importante. Il est à noter, actuellement, le matériel nécessaire pour une digitale PCR n'est pas facilement disponible. L'utilisation d'une dPCR requiert, généralement, un volume important de réactif, afin de pouvoir procéder à la partition multiple. Ceci est considéré comme conséquent économiquement. V. [...]
[...] Disponibilité sur : https://www.youtube.com/watch?v=Z_dn6Oz-uaA Figure 1 : La PCR conventionnelle est une mesure extrapolée d'acides nucléiques à partir de modèles déjà mesurés, peu précise. La dPCR est une mesure «numérique» des acides nucléiques quantitativement. Figure 2 : Les étapes clés de la dPCR sont indispensables à son bon fonctionnement. Figure 3 : Face à une forte concentration d'inhibiteur, la PCR conventionnelle (Real-Time) est peu efficace tandis que la dPCR a un seuil de tolérance plus important. Figure 4 : Un exemple de thermocycleur de la dPCR. [...]
[...] La digitale PCR reste la plus rapide, efficace et simple à manipuler à ce jour. Même si elle doit encore faire ses preuves afin d'être utilisée systématiquement en laboratoire. Nous pourrions par la suite nous imaginer une dPCR améliorée dans un monde comme le nôtre sans cesse en développement. Celle-ci aurait un moindre coût afin d'accélérer l'avancée de la science pour les applications biomédicales par exemple. Références - CAO et al. Biosensors and bioeletronics, Science Direct [en ligne] [décembre 2017]. [...]
[...] Aujourd'hui, la dPCR suscite un intérêt conséquent pour la recherche. En effet, elle présente de nombreux avantages comparés aux anciennes techniques PCR comme sa justesse, sa performance et sa clarté. Un échantillon contenant, bien évidemment, de l'ADN est reparti dans des milliers de partitions individuelles afin d'obtenir l'échelle du nano. Il existe diverses méthodes concernant la dispersion de l'échantillon comme : à base de gouttelettes, à base de canaux, à base de billes d'hydrogel, etc. Néanmoins, cette technique d'amplification est très complexe comme nous allons le constater tout au long de cette revue. [...]
À propos du contributeur
Juline L.étudiant- Niveau
- Grand public
- Etude suivie
- biologie
- Ecole, université
- UFR...
Descriptif de l'étude de cas
- Date de publication
- 2019-06-26
- Date de mise à jour
- 2019-06-30
- Langue
- français
- Format
- Word
- Type
- étude de cas
- Nombre de pages
- 4 pages
- Niveau
- grand public
- Téléchargé
- 0 fois
- Validé par
- le comité de lecture
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